谢谢你，pangding版主:)
可以请教你，若是用c++语言，应该如何写此程序呢？
我试着把档案该小过1GB，再做比较...
有些简单的计算，awk或许会蛮快...
但若是复杂些的计算，可能就要比较耗时 :(
我准备多些档案后，迟点再上载来，供大家讨论和分享 :)

我主要遇到的问题，是不知该如何运用c++，来读取及分析一个档案的内容...分析后，又该如何将其储存于另一个档案 :(
用awk/sed/perl最方便的地方，或许是只需要在工作业面，输入要读取档案的名称后，利用“〉”符合，将分析结果，储存于另一个新档案...
我理想利用c++语言写好程序后的处理格式是：

c++程序名称 读取档案名称 结果档案名称
eg.
a.out input_file.txt output_file.txt

若是以我提出的例子，c++的程序比awk/sed/perl慢些也没关系...
我主要是希望可以透过此例子，慢慢熟悉如何利用c++来写程序，分析数据...
谢谢...
请多指教 :)

要求速度的话确实是c比较快，测试31M+的文件时间0.766秒左右，计算个数20808964，62M+的文件时间1.65左右。不过对于大文件的话，时间会大于线性了，文件小，我是一次读入内存的。

你好，请问可以分享你的c++程序吗？
希望可以更熟悉c++程序，是如何处理我的案例，谢谢噢 :)

测试文件581M，计算个数350000000。
用C写耗时8.9秒左右。内存映射文件耗时15秒左右。
用C++单存的按行读取耗时172秒。，这个也很夸张，要保证将一行的数据读完，我使用了string，而他可能会导致内存的频繁分配释放，速度肯定慢。若按照固定大小来读取那么数据处理方法与C的就一样了，差别在于I/O处理速度上。这个就没有测试了。LZ确定要用C++来处理、
你说下用你的方法处理的耗时看看。。

你好，这是我使用的c++程序内容：

// aa.cpp : Defines the entry point for the console application.
//

#include "stdafx.h"
#include <stdio.h>
#include <string.h>

int main(int argc, char* argv[])
{
FILE *pOpen;
char chBuf[200];
int nSum=0;
long nLen=0;
int k;
pOpen = fopen("d:\\aa.txt","r"); //打开文件

if (pOpen==NULL)
{
printf("打开文件失败");
}
else
{
//打开文件成功，读取内容
fread(chBuf,200,1,pOpen);
//开始统计
nLen = strlen(chBuf);
for(int k=0;k < nLen;k++)
{
if(chBuf[k]=='A' || chBuf[k]=='C' || chBuf[k]=='G' || chBuf[k]=='T' || chBuf[k]=='N')
{
nSum++;
}
}
fclose(pOpen);
}

printf("%d\n",nSum);

return 0;
}

以上的程序，处理小档案，没有很大问题...
但还是有些不足的地方：
1.档案的名称，必须在c++程序内列明（如：aa.txt）;
2.无法把结果，显示在新的档案内;

我理想的c++程序，是希望能按照一下的格式：

c++程序名称 读取档案名称 结果档案名称
eg.
a.out input_file.txt output_file.txt
a.out input_file2.txt output_file2.txt

非常感谢您的意见及改写以上的c++程序 :)

额，你这是C程序啊，不是C++。并且你这个貌似与你说的要求不一样吧，

int main(int argc,char **argv)
{
    FILE *pf=fopen(argv[1],"rb+");
    fseek(pf,0,SEEK_END);
    int filesize=ftell(pf);
    fseek(pf,0,SEEK_SET);

    int num=1024*1024;
    char *pbFile=new char[num+1];
    bool bFlag=false;
    int target[26]={0};
    if(pbFile==NULL)
    {
        printf("new error");
        return -1;
    }
    while(filesize>0)
    {
        if(filesize<num)
            num=filesize;
        fread(pbFile,num,1,pf);
        for(int i=0;i<num;i++)
        {
            while((i<num && pbFile[i]=='>') || bFlag)
            {
                bFlag=true;
                while(i<num && pbFile[i]!='\n')i++;
                if(i<num)
                {
                    bFlag=false;
                    i++;
                }
                else if(i==num)
                    break;
            }
            while(i<num && pbFile[i]!='\r' && pbFile[i]!='\n')
               target[pbFile[i++]-65]++;
        }
        filesize-=num;
    }
    delete []pbFile;
    fclose(pf);

    FILE *p=fopen(argv[2],"r+");
    fprintf(p,"%d",target[0]+target['G'-'A']+target['C'-'A']+target['T'-'A']);
    fclose(p);
    cout<<target[0]+target['G'-'A']+target['C'-'A']+target['T'-'A']<<endl;
    return 0;
}

给你这个参考吧，用法就和你说的一样，命令行参数。

你好，谢谢你噢 :)
我会好好消化您所分享的c++程序...
c和c++，我也有些混淆了 :(

我在使用您的c++程序时，是否该增加"#include <stdio.h> #include <stdlib.h>"在其开头?

#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>

int main(int argc,char **argv)
{
    FILE *pf=fopen(argv[1],"rb+");
    fseek(pf,0,SEEK_END);
    int filesize=ftell(pf);
    fseek(pf,0,SEEK_SET);
.
.

谢谢您的确认...
您所写的c++程序，分析数据很快 :)

像这种需求简单的位置参数用 玩出来 展示的方法就可以很好的分析出来。
不过一般需要测一测 argv 是不是大于2的，适当检查一下命令行的语法错误。

另外，楼主其实应该也感觉，这种程序就用输入输出重定向就行。让程序处理标准输入输出流是命令行程序的传统（即写成过滤器程序）。

如果对命令行分析有其它更复杂的要求，一般会用一些库来做。posix 标准要求的函数有 getopt()，你可以自己去查一查它的用法。