不同的文件夹存放在同一根文件夹中，安全吗？

网站中有四个不同的文件夹，用来分别存放不同类型的word或excel文件，供用户进行上传和下载文件。想将这四个文件夹均放在另外一个文件夹中方便文件的管理，出于安全方面的考虑，这种做法妥当吗？