重装系统后软件安装

叫别人重装了Win2000系统。好象是用的番茄花园的自动安装盘。
但是原来装在"C:\Program Files"里的软件都还在，有些能用，有些提示找不到动态连接文件。而在开始/程序菜单里这些软件都看不到，在控制面版/添加/删除程序里也没有。 这是怎么回事？是没格C盘吧。
我想把原来的软件都删了，再装。或者在“开始/程序菜单”和“控制面版/添加/删除程序”里能看到，能操作。又该如何做？不会又要再装一遍系统吧。